GENETIKA, Vol. 47, broj 2 (2015)
Jelena BOŠKOVIĆ
In memoriam prof dr Janoš Berenji (1954-2015)
Kulpash BULATOVA, Raushan MASSONICHICH-SHOTUNOVA, Galiolla MeiIrman, Shynar Mazkirat
DIVERGENTNOST UZORAKA ESPARZETE (Onobrychis Mill.) KOLEKCIJE PREMA SPEKTRU REZERVNIH PROTEINA [Izvod] [Rad]
Khosro MOHAMMADI i Reza TALEBI
MEĐUSOBNI ODNOS GENETIČKE ANALIZE PRINOSA SEMENA I MORFOLOŠKIH OSOBINA MINI KOLEKCIJE IRANSKIH SORATA, SAMOPLODNIH LINIJA I POBOLJŠANIH GENOTIPOVA LEBLEBIJE (Cicer arietinum L.) [Izvod] [Rad]
ISPITIVANJA GENSKOG PULA I GENEOLOŠKIH VEZA IZMEĐU GENOTIPOVA OVACA JUŽNE RUSIJE KORIŠĆENJEM KRVNIH GRUPA I DNK MIKROSATELITA [Izvod] [Rad]
Gordana S TIMOTIJEVIĆ, Mira
DJ MILISAVLJEVIĆ, Dragana B NIKOLIĆ, Boško M MILOVANOVIĆ, Dragana S NIKOLIĆ,
Miroslav NIKOLIC, Jelena T SAMARDŽIĆ
USPOSTAVLJANJE I VALIDACIJA „STEM-LOOP RT PCR” METODE
ZA ANALIZU EKSPRESIJE MIKRORNK398 GENA [Izvod] [Rad]
Zahra ERFANIASL, Ali HASHEMI, Ghorban Elyasi ZARRINGHABAIE, Mohammad FARHADIAN
VARIRANJE OSOBINA ŽIVOTNE ISTORIJE KOD Drosophila subobscura U USLOVIMA ZAGAĐENJA OLOVOM ZAVISI OD POPULACIONE ISTORIJE [Izvod] [Rad]
Li-jing CHEN, Hong-mei LI , Shao-kun SUN, Muhammad IRFAN, Jing-wei LIN, Ming ZHONG, Hui MA, Zhi-Fu GUO, Tian-lai LI
KOSTRUKCIJA GENETIŠKE MAPE UKOPČANOSTI KOD KRINA PRIMENOM RAIL MAPIRANJA POPULACIJE ZASNOVANA NA SRAP MARKERIMA ERIMENTIMA [Izvod] [Rad]
Svetlana VOJVODIĆ i D. АDEMOVIĆ-SAZDANIĆ
ANALIZA NERAVNOTEŽE VEZIVANJA ALELA KILLER CELL IMUNOGLOBULIN-LIKE RECEPTOR GENA U POPULACIJI VOJVODINE [Izvod] [Rad]
Malahat TABAN, Masoud SHEIDAI, Zahra NOORMOHAMMADI, Narjes AZIZI, Somayeh GHASEMZADEH-BARAKI, Fahimeh KOOHDAR
POPULACIONO - GENETIČKA ANALIZA I EVIDENCIJA UNUTAR SPECIJSKE INTROGRESIJE KOD Helichrysum armenium and H. rubicundum (Asteraceae) [Izvod] [Rad]
ZNAČAJ GENSKE VARIJANTE C20068T U 3’ KRAJU GENA ZA PROTROMBIN U ETIOLOGIJI PONOVLJENIH SPONTANIH POBAČAJA: PILOT STUDIJA [Izvod] [Rad]
Hongmei SONG, Yingchen WEI, Nan LI, Bin WU, Na XIE, Heming WANG
WENYANGBUSHEN-INDUKOVANA-EXPRESIJA VEGF, OPG, RANK I RANKL KOD KUNIĆA SA STEROID-INDUKOVANOM AVASKULARNOM NEKROZOM FEMORALNE GLAVE [Izvod] [Rad]
Ana NIKOLIĆ, Dragana IGNJATOViĆ-MICIĆ, Dragan KOVAČEVIĆ, Zoran
ČAMDŽIJA, Milomir FILIPOVIĆ,
Snežana MLADENOVIĆ DRINIĆ
PROCENA GENETIČKOG
DIVERZITETA LINIJA KUKURUZA PRIMENOM SSR MARKERA [Izvod] [Rad]
Abbas DOOSTI, Payam GHASEMI-DEHKORDI, Mohammad KARGAR, Abolghasem SHARIFI
GENERISANJE DIVALENTNE DNK VAKCINE ZASNOVANO NA p39 I shiga-like toxin 2 (stx2) GENU [Izvod] [Rad]
Željko LAKIĆ, Igor BALALIĆ, Svetko VOJIN
INTERPRETACIJA INTERAKCIJE GENOTIP × SPOLJAŠNJA SREDINA KOD ENGLESKOG LJULJA (Lolium perenne L.) [Izvod] [Rad]
M. YASODHA and P. PONMUTHURAMALINGAM
KLASIFIKACIJA MIKROZONA EKSPRESIJE GENA PRIMENOM ELM (EXTREME LEARNING MACHINE) [Izvod] [Rad]
Parul BANERJEE and Bashisth Narayan SINGH
ISPITIVANJA FLUKTUIRAJUĆE ASIMETRIJE (FA) ZA NEKE MOFOLOŠKE OSOBINE KOD ČETIRI VRSTE Drosophila bipectinata KOMPLEKSA [Izvod] [Rad]
Ahmad Reza GOLPARVAR, Mohammad Mehdi GHEISARI, Davoud NADERI, Ali Mehras MEHRABI, Amin HADIPANAH, Saeed SALEHI
DETERMINACIJA NAJBOLJIH INDIREKTNIH SELEKCIONIH KRITERIJUMA KOD IRANSKI GENOTIPOVA TVRDE PŠEICE (Triticum aestivum L.) U USLOVIMA NAVODNJAVANJA I STRESA SUŠE [Izvod] [Rad]
Mehrzad ALLAHGHOLIPOUR, Ezatollah FARSHDFAR, Babak RABIEI
KOMBINACIONA SPOSOBNOST I NASLEDNOST SELEKCIONISANIH SORATA PIRINČA NA PRINOS ZRNA, KOMPONENTE PRINOSA I KARAKTERISTIKE KVALITETA ZRNA [Izvod] [Rad]
Vladan POPOVIĆ, Aleksandar LUČIĆ, Danijela RISTIĆ, Ljubinko RAKONJAC, Sabahudin HADROVIĆ, Snežana MLADENOVIĆ DRINIĆ
ANALIZA UNUTARPOPULACIONOG VARIJABILITETA TAKSODIJUMA (Taxodium distichum L. Rich.) U SEMENSKOJ SASTOJINI KOD BAČKE PALANKE UPOTREBOM RAPD MARKERA [Izvod] [Rad]
Esmaeel GHOLINEZHAD, Reza DARVISHZADEH, Iraj BERNOUSI
EVALUACIJA KOMPONENATA PRINOSA SUNCOKRETA POD RAZLIČITIM USLOVIMA STRESA NEDOSTATKA VODE [Izvod] [Rad]
Alena GAJDOŠOVÁ, Tatjana VUJOVIĆ, Miroslava SÚKENÍKOVÁ, Gabriela LIBIAKOVÁ
RAZVIJANJE SISTEMA ZA ADVENTIVNU ORGANOGENEZU I REGENERACIJU TRANSGENIH BILJAKA KUPINE [Izvod] [Rad]
Klaudija DAUGĖLAITĖ, Danielius SERAPINAS
ZNAČAJ DETEKCIJE MUTANTA GENA MTHFR KOD PACIJENATA SA PONAVLJUĆIM POBAČAJIMA [Izvod] [Rad]
Afet MAMMADOVA, Ramiz ALIYEV, Sevda BABAYEVA, Mehraj ABBASOV
ADAPTIVNA REAKCIJA VRSTA PAMUKA G. hirsutum ,L. i G. barbadense L. NA STRES SUŠE [Izvod] [Rad]
Dejana SAVIC, Dragana JOSIC, Elizabeta RISTANOVIC, Radmila PIVIC, Aleksandra STANOJKOVIC-SEBIC, Zorica LEPSANOVIC
DETEKCIJA GENA ZA PRODUKCIJU TOKSINA I RAPD ANALIZA Bacillus cereus IZOLATA IZ RAZLIČITIH TIPOVA ZEMLJIŠTA [Izvod] [Rad]
Lydia Shtereva, Roumiana Vassilevska-Ivanova*, Boris Kraptchev
PROCENA TOLERANTNOSTI NA SUŠU NOVIH GENOTIPOVA KUKURUZA ŠEĆERCA U BUGARSKOJ PRIMENOM POKAZATELJA TOLERANTNOSTI NA STRES [Izvod] [Rad]
Dragana MILOŠEVIĆ, Ivana STANKOVIĆ, Aleksandra BULAJIĆ, Maja IGNJATOV,Zorica NIKOLIĆ, Gordana PETROVIĆ, Branka KRSTIĆ
DETEKCIJA I MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA VIRUSA BLAGOG ŠARENILA PAPRIKE (Pepper mild mottle virus) U SRBIJI [Izvod] [Rad]
M. MOAEEN-UD-DIN, G. BILAL i James M. REECY
EVOOLUCIJA RASTA HIPOTALAMUS - PITUITARI OSOVINE RIBE, AMFIBIJE, PTICA I ŽIVOTINJA [Izvod] [Rad]
Uroš ŽIVKOVIĆ, Danijela MILJKOVIĆ, Nataša BARIŠIĆ KLISARIĆ, Aleksej TARASJEV, Stevan AVRAMOV
ODGOVOR GENOTIPOVA Iris variegata NA RAZLIČITE SVETLOSNE USLOVE: FENOLOGIJA CVETANJA I REPRODUKTIVNI USPEH [Izvod] [Rad]
Sandra PETROVIĆ, Andreja LESKOVAC, Ivana JOKSIĆ, Dragana VUJIĆ,Ana Valenta ŠOBOT, Jelena FILIPOVIĆ and Gordana JOKSIĆ
ISPITIVANJE POJEDINAČNIH NUKLEOTIDNIH POLIMORFIZAMA U 52 GENA UKLJUČENA U DNK REPER I KONTROLU ĆELIJSKOG CIKLUSA KOD PACIJENATA OBOLELIH OD FANKONIJEVE ANEMIJE OSTRVA [Izvod] [Rad]
F. Izadpanah, S. Kalantari, M. E. Hassan, M. R. Naghavi, M. Shokrpour
MOLEKULARNO I MORFOLOŠKO VARIRANJE NEKIH GENOTIPOVA IRANSKOG ŠAFRANA (Crocus sativus L.) [Izvod] [Rad]
Milena CVETKOVIĆ, i Perica VASILJEVIĆ
RUKOST I FENOTIPSKE KARAKTERISTIKE GLAVE I LICA [Izvod] [Rad]
Sahar
GOHARI-LASAKI, Jalal GHARESOURAN, Morteza GHOJAZADEH2,Vahid MONTAZERI, Hakimeh SAADATIAN, ,Seyyed MOJTABA MOHADDES
ARDEBILI
MUTANT GENA XRCC3 241Met KOJI KONTROLIŠE POPRAVKU DNK I OSETLJIVOST KANCERA DOJKE KOD AZERI
POPULACIJE U IRANU[Izvod] [Rad]
Khaled F M Salem
ALELNI STATUS MIKROSATELITSKOG MARKERA Xgwm261 GENA Rht8 KOD GENOTIPOVA EGIPATSKE HLEBNE PŠENICE (Triticum aestivum L.) PRIZNATIH UPERIODU 1947 – 2014 [Izvod] [Rad]
Milan MIROSAVLJEVIĆ, Novo PRŽULJ, Vojislava MOMČILOVIĆ, Nikola HRISTOV, Ivana MAKSIMOVIĆ
AKUMULACIJA I REMOBILIZACIJA SUVE MATERIJE KOD OZIMOG JEČMA U ZAVISNOSTI OD GENOTIPA I ROKA SETVE [Izvod] [Rad]
Suzana CVJETIĆANIN
ANTROPOGENETIČKA VARIJABILNOST U GRUPAMA HOMO- I HETROSEKSUALNO OPREDELJENIH POJEDINACA [Izvod] [Rad]
Korekcija:
Popović V., A. Lučić, M. Šijačić-Nikolić, T. Ćirković-Mitrović, Lj. Rakonjac, B. Cvetković and S. Mladenović Drinić (2014): Analysis of inter-line variability of bald cypress (Taxodium distichum L. Rich.) juvenile seedlings using morphometric markers-. Genetika, Vol 46, No. 1, 117-128. [Correction]
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47 broj 2 (2015), str: 375-382
© 2015 Društvo genetičara Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575.630
Originani naučni rad
DIVERGENTNOST UZORAKA ESPARZETE (Onobrychis Mill.) KOLEKCIJE PREMA SPEKTRU REZERVNIH PROTEINA
Kulpash BULATOVA1 *, Raushan MASSONICHICH-SHOTUNOVA2,
Galiolla MeiIrman1, Shynar Mazkirat1
1 Kazak istraživački Institut za Poljoprivredu gajenje žitarica, Almalibak, Karasaj district, Almati region, Republika Kazahstan.
2Kazak istraživački centar za stočarstvo i prozvodnju stočne hrane, Almati, Republika Kazahstan.
Izvod
Esparzeta (Onobrychis Mill.)je važna biljka za stoćnu hranu u porodici leguminoza (Fabaceae). U Kazahstan je uvedena u gajenje u poljskim uslovima sredinom 20. Veka i zbog biolođkih osobina široko gajena u kao perspektivan izvor za proizvodnje stočne hrane. Analiza rezervnih proteina Onobrychis viciifolia, Onobrychis arenaria i Onobrychis transcaucasica vrsta je vršena gelelektroforezom. Utvrđena je začajna divergentnost broja, mobilnosti i intenziteta pojedinih komponenata.
Autor za kontakt: Kulpash Bulatova, Laboratorija za molekularno biološke analize biljaka, Kazakh poljoprivredni naučni institut , 040909, Erlepesov Street 1, v. Almalybak, Karasay district, Almaty region, Republika Kazakhstan, tel: +7 72771 53 130. E-mail: bulatova_k@rambler.ru
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2(2015), str: 383 -393
© 2014 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575.633
Originani naučni rad
MEĐUSOBNI ODNOS GENETIČKE ANALIZE PRINOSA SEMENA I MORFOLOŠKIH OSOBINA MINI KOLEKCIJE IRANSKIH SORATA, SAMOPLODNIH LINIJA I POBOLJŠANIH GENOTIPOVA LEBLEBIJE
(Cicer arietinum L.)
Khosro MOHAMMADI i Reza TALEBI*
Poljoprivredni fakultet, Islamski Azad Univerzitet, Sanandajogranak, Sanandaj, Iran
Izvod
Vršena su ispitivanja asocijacije genetičkih parametara i morfoloških osobina 2012/2013 sezone gajenja kod 46.različitih sorata, smooplodnih linija i gajenih genoipova leblebije (Cicer arietinum L.). Vršena je analiza genetičke varjanse, varijanse fenotipa i uslova sredine, koeficijent variranja, naslednost, koeficijent korelacije, određivanje pat koeficijenta kao i konstrukcija dendograma (klaster analiza). Visoke vrednosti naslednosti ispitivanih osobina pokazuju da su te osobine velikim delom pod kontrolom aditivnih gena i da selekcija na te osobine može da bude efektivna u povećanju prinosa zrna. Germplazma je grupisana u tri grupe (klastera). Svaka grupa (klaster) ima sopstvene specifične karakteristike a klaster I se jasno razdvaj od klastera II i III. Zaključeno je da se prinos leblebije može povećati selekcijom idiotipa koji imaju veći broj zrna po biljci, veću težinu 100 zrna i veću biomasu.
Autor za kontakt: Reza Talebi, Poljoprivredni fakultet, Islamski Azad Univerzitet, Sanandajogranak, Sanandaj, Iran.email: srtalebi@yahoo.com
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 395- 404
© 2015 Društvo genetičara Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575.630
Originani naučni rad
ISPITIVANJA GENSKOG PULA I GENEOLOŠKIH VEZA IZMEĐU GENOTIPOVA OVACA JUŽNE RUSIJE KORIŠĆENJEM KRVNIH GRUPA I DNK MIKROSATELITA
Natalia.A.ZINOVIEVA1, Marina.I.SELIONOVA2, Elena.A.GLADYR1, Milan.P. PETROVIC3, Violeta. CARO PETROVIC3, Dragana. RUZIC MUSLIC3, Milan.M.PETROVIC3
1 Sve – ruski istraživački Institut zastočarstvo, Moskva, Rusija
2 Sve – ruski istraživački Institut za ovce i koze, Stavropolj, Rusija
3 Institut za stočarstvo, Beograd – Zemun, Srbija
Izvod
U istraživanjima su korišćene dve klase genetičkih markera – krvne grupe i DNK mikrosateliti. Uključeni su uzorci ovaca merino rasa fine vune: grozni (GR), kavkaska (CA), manički merino (MM), sovjetski merino (SM), stavropoljski (ST) i gruborune rase: edilbaevska (ED), karakul (CR) i romanovska (RO). Za proučavanje eritrocita, izabrani su antigeni (krvne grupe) u 1159 uzoraka sa 11 fari. Za ispitivanje DNK mikrosatelita uzeto je 598 uzoraka sa 10 farmi ovaca. Mikrosatelitska analiza pokazala je da najveću polimorfnost ima stavropoljska rasa ovaca gde je identifikovano u proseku 18,27 alela po lokusu. Najmanje vrednosti su utvrđene kod romanovske rasa ovaca - 9.7 alela po lokusu. Minimalna genetska distanca ustanovljena je između rasa grozni i sovjetski merinos - 0.0569 (za mikrosatelite) i 0.0741 (krvne grupa - kasnije u istom redosledu). Između rasa stavropoljska - grozni 0.0861 i 0, 0810; stavropoljska i sovjetski merino 0.0861 i 0.1094. Takođe, relativno bliske su populacije grozni - edilbaevska, grozni - karakul, edilbaevska - karakul: 0.1364 i 0.0851; 0,1620 i 0.1208; 0.1875 i 0,1192. Najveća genetička distanca bila je između Stavropoljske rase i Karakula - 0,2664 i 0.1804, kao i između Romanovske i svih ispitivanih populacija - 0.2491 ... 0.3211 i 0.1734 ... 0.2235.
Autor za kontakt: Milan P. Petrovic, Institut za stočarstvo, Beograd – Zemun, Srbija
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 405-416
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
USPOSTAVLJANJE I VALIDACIJA „STEM-LOOP RT PCR” METODE
ZA ANALIZU EKSPRESIJE MIKRORNK398 GENA
GORDANA S. TIMOTIJEVIĆ1*, MIRA Đ. MILISAVLjEVIĆ1, DRAGANA
B. NIKOLIĆ1, BOŠKO M. MILOVANOVIĆ2, DRAGANA S. NIKOLIĆ1,
MIROSLAV NIKOLIĆ3 i JELENA T. SAMARDŽIĆ1
1Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo,
Univerzitet u Beogradu, Beograd, Srbija,
2Geografski institut „Jovan Cvijić“, Srpska akademija nauka i umetnosti, Beograd, Srbija
3Grupa za mineralnu ishranu biljaka, Institut za multidisciplinarna istraživanja, Univerzitet u Beogradu, Beograd, Srbija
Izvod
Mikro RNK (miRNK), klasa malih nekodirajućih RNK molekula, imaju značajnu ulogu tokom razvića, kao i u odgovoru na različite stresogene faktore spoljašnje sredine. Neke od biljnih mikro RNK imaju važnu ulogu u finoj regulaciji i održavanju homeostaze nutrijenata u uslovima kada je određeni element prisutan u višku ili manjku u odnosu na optimalnu koncentraciju za biljku. Za razumevanje bioloških funkcija određenih miRNK neophodno je razvijanje efikasne metodologije za praćenje njihove genske ekspresije. U okviru ovog rada pokazujemo uspostavljanje i validiranje metode za analizu miRNK genske ekspresije u krastavcu u uslovima deficijencije gvožđa. Reverzna transkripcija “stem-loop” prajmerima u kombinaciji sa „Real-time PCR“ metodom je jedan od načina za kvantifikaciju ekspresije miRNK. Prikazan je postupak dizajniranja „stem-loop” prajmera specifičnih za miRNK398, optimizacija i određivanje efikasnosti odgovarajuće „Real-time PCR“ reakcije. Ovaj pristup omogućio nam je uvid u promene nivoa ekspresije miRNK398 u model biljci gajenoj u različitim uslovima deficijencije gvožđa. Metod jeverifikovan poređenjem dobijenih podataka sa rezultatima ekspresije miRNK398 u istim uzorcima, primenom komercijalnog kita. Potvrđivanje tačnosti metode od velikog je značaja s obzirom na to da se zarazliku od „stem-loop RT” gde se vrši odvojena transkripcija target gena i endogene kontrole, komercijalnim kitom efikasno izvod i simultana konverzija svih RNK u cDNK.. .
Autor za kontakt: Gordana Timotijević, Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo, Univerzitet u Beogradu, VojvodeStepe 444a, PO box 23, 11010 Beograd, Srbija, Fax: +381113976414, e-mail: timotijevic@imgge.bg.ac.rs
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj2(2015), str: 417 –424
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
ASOCIJACIJA POLIMORFIZMA INTERLEUKIN – 2 GENA SA OSOBINAMA JAJA U NATIVNOJ POPULACIJI ĆURKE
Zahra ERFANIASL1*, Ali HASHEMI1, Ghorban Elyasi ZARRINGHABAIE2, Mohammad FARHADIAN3
1 Odelenje zooloških nauka, Poljoprivredni fakultet, Urmia Univerzitet, Urmia, Iran
2 Naučni član Centra zs istraživanja poljoprivrednih i prirodnih resursa Provincije Istočni Azerbejdžan, Tabriz, Iran
3 Mladi istraživači i elitni klub, Khoy Ogranak, Islamski Azad Univerzitet, Khoy, Iran
Izvod
Polimorfizam Interleukin – 2 gena kod nativnih ćurki u Zapadnom Azerbejdžanu je analiziran primenom PCR metoda i tehnike SSCP ( Single-stranded conformation). Uzorci DNK 185 ćurki su izolovani iz cele krvi. 523-bp IL2 drugi egzon sa delom segmenta trećeg introna je standardno amplifikovan primenom PCR korišćenjem lokus – specifičnih prajmera. Vršena su ispitivanja odnosa molekularnog polimorfizma u drugom egzonu sa delom regiona trećeg egzona interleukina – 2 i broja jaja, prosečne težine jaja i težine mase produkcije jaja. Dobijeni rezultati pokazuju da je AA genotip asociran sa brojem jaja i težine produkcije jaja (P ≤ 0.01). Nije nađena korelacija između drugog egzona i dela trećeg introna iInterleukin – 2 varijanti sa prosečnom težinom jaja. Očekuje se da ti geni mogu biti kandidati u genetičkom poboljšanju nekih ekonomski značajnih osobina ćurke u programima oplemenjivanja.
Autor za kontakt: Mohammad Farhadian, Mladi istraživači i elitni klub, Khoy Ogranak, Islamski Azad Univerzitet, Khoy, Iran,E-mail: Mohammad.farhadian@tabrizu.ac.ir
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2(2015), str: 425-438
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575:630
Originani naučni rad
KOSTRUKCIJA GENETIŠKE MAPE UKOPČANOSTI KOD KRINA PRIMENOM RAIL MAPIRANJA POPULACIJE ZASNOVANA NA SRAP MARKERIMA
Li-jing CHEN, Hong-mei LI , Shao-kun SUN, Muhammad IRFAN, Jing-wei LIN,
Ming ZHONG, Hui MA, Zhi-Fu GUO, Tian-lai LI
Glavna Laboratorija poljoprivredne biotehnologije Liaoning provincije, Glavna Laboratorija u zaštiti hortikulturnih biljaka (Ministarstvo za obrazovanje), Fakultet bioloških nauka i biotehnologije, Shenhjang Poljoprivredni Univerzitet, Shenjang 110866, Kina.
Izvod
Genetička mapa ukopčanosti je konstruisana, korišćenjem rekombinovanih samooplodnih linija (RIL) u populaciji od 180 individua. Populacija je konstruisana ukrštanjem Raizan No.1 (Formolongo) i Gelria (Longiflomm) kultivara selekcijom pojedinačnih zrna (SSD) SRAPs markeri su generisani korišćenjem restrikcionih EcoR1 u kombinaciji sa MseI. Segregacija svakog markera i analiza ukopčanosti je vršena primenom Mapmaker3.0. Sa 50 parova prajmera detektovano je ukupno 189 roditeljskih polimorfnih traka a 78 je korišćeno u mapiranju. Ukupna dužina mape je bila 2,135.5 cM koja se sastoji od 16 grupa ukopčanosti. Mapa konstruisana u ovim istraživanjima je prva bazirana na markerima zasnovanim na polimorfizmu markera amplikovanih skvenci rekombinovanih linija krina i može da se koristi u marker – asistiranom oplemenjivanju i mapiranju lokusa koji kontrolišu kvantativne osobine krina.
Autor za kontakt: Li-jing Chen, E-mail: chenlijing1997@126.com, Phone: +86-24-88487163, Fax: +86-24-88492799.Tian-lai Li，E-mail: litianlai@126.com, Phone: +86-24-88487143, Fax: +86-24-88487143
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 439-450
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
ANALIZA NERAVNOTEŽE VEZIVANJA ALELA KILLER CELL IMUNOGLOBULIN-LIKE RECEPTOR GENA U POPULACIJI VOJVODINE
Svetlana VOJVODIĆ i D.
АDEMOVIĆ-SAZDANIĆ
1Zavod za transfuziju krvi Vojvodine, Služba za laboratorijsku
dijsagnostiku, Laboratorija za tipizaciju tkiva, Univerzitet u Novom Sadu,
Medicinski fakultet u Novom Sadu
Killer cell Imunoglobulin-like Receptori (KIRs) predstavljaju grupu regulatornih molekula koje
Izvod
Killer cell Imunoglobulin-like Receptori (KIRs) predstavljaju grupu regulatornih molekula koje moduliraju citolitičnu aktivnost prirodnih ćelija ubica i T ćelija putem interakcije sa molekulama specifičnih humanih leukocitnih antigena (HLA) na ciljnim ćelijama. KIRs su kodirani od strane grupe od 16 homolognim gena koji značajno variraju unutar haplotipova i pokazuju sekvencioni polimorfizam sa alelnim varijacijama koji takođe doprinose raznovrsnosti u okviru genskog kompleksa. Cilj studije je da ispita neravnotežu vezivanja alela za 16 KIR lokusa. U ovoj studiji, prikazan je sadržaj KIR gena, alelne, hapolotipske i frekvencije genotipova u 175 nesrodnih zdravih osoba iz Vojvodine, kod kojih je izvršena KIR genotipizacija metodom lančane reakcije polimeraze-sekvenciono specifičnim prajmerima. Neravnoteža vezivanja alela ili disekvilibrijum linkaže (LD) je ispitivana na strukturnom nivou (prisustvom ili odsustvom 16 KIR gena). Naši rezultati ukazuju da neravnoteža vezivanja alela postoji između telomernih parova gena KIR2DL1 ~ KIR2DL4, KIR2DP1 ~ KIR2DL4, KIR2DP1 ~ KIR3DL1, KIR2DL1 ~ KIR3DL2, KIR2DP1 ~ KIR3DL2, KIR2DL4 ~ KIR3DL1, KIR2DL4 ~ KIR2DS4, KIR2DL4 ~ KIR3DL2 gde je (r2 = 1), ali pozitivna asocijacija između KIR gena, uz više uočene od očekivanih hapolotipskih frekvencija su dobijene za KIR3DS1 ~ KIR2DS1 i KIR2DL5 ~ KIR2DS1 parove gena (r2 = 0,646) i (r2= 0.371), odnosno. Identifikovano je trideset-osam različitih genotipova, gde 12% osoba ima jedinstven genotip, prisutan samo kod jedne osobe. Naši rezultati će pomoći u razumvanju genetske osnove vojvođanske populacije, u ilustraciji migracija stanovništva u severnom delu Srbije, u objašnjenju opsežne genetske mešavine različitih etničkih grupa u regionu, kao i u studijama povezanosti KIR gena sa bolestima.
Autor za kontakt: Svetlana Vojvodić, M.D., Ph.D., Institute for Blood Transfusion of Vojvodina, Department for Laboratory Diagnostics, Tissue Typing Compartment, Hajduk Veljkova 9a, 21000 Novi Sad, Serbia; Tel.: +381-21-4877-963; Fax: +381-21-4877-978; Mobile: +381-64-861-58-12; E-mail: svetlana.vojvodic021@gmail.com
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015),
str: 451 -468
© 2015 Društvo genetičara Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575:630
Originani naučni rad
POPULACIONO - GENETIČKA ANALIZA I EVIDENCIJA UNUTAR SPECIJSKE INTROGRESIJE KOD Helichrysum armenium and H. rubicundum (Asteraceae)
Malahat TABAN1, Masoud SHEIDAI1, Zahra NOORMOHAMMADI2*, Narjes AZIZI1, Somayeh GHASEMZADEH-BARAKI1, Fahimeh KOOHDAR1
1 Fakultet bioloških nauka, Shahid Beheshti Univerzitet, Teheran, Iran
2 Odelenje za biologiju, Škola nauke, Ogranak za nauku i istraživanja, Islamiski Azad Univerzitet, Teheran, Iran
Izvod
Helichrysum armenium i H. rubicundum su značajne lekovite biljke za Iran i proširene su u različitim regionima Irana. Vršena su istraživanja 66 slučajno sakupljene biljke iz 24 populacije Helichrysum armenium and H. rubicundu. UPGMA and MDS analizama su potvrđene morfološke separacije ovevrlo bliske biološke vrste a intermedijalne biljke su smeštene u intermedijalnu poziciju. ISSR analize su potvrdile inter-populacioni genetički diverzitet a analize K- sredine , grupisanja i strukture su pokazale genetičku u ispitivanim vrstama. Kombinacijom genetičke startifikacije i genetičkog mešanja kao i poliploidija i strukturalne promene hromozoma su igrale ulogu kod Helichrysum diverzifikaciji.
Autor za kontakt: Zahra Noormohammadi, Odelenje za biologiju, Škola nauke, Ogranak za nauku i istraživanja, Islamiski Azad Univerzitet, Teheran, Iran, Tehran, Iran,,Tel/Fax: +98 21 44865939,Email address: marjannm@yahoo.com z-nouri@srbiau.ac.ir
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 469-476
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
ZNAČAJ GENSKE VARIJANTE C20068T U 3’ KRAJU GENA ZA PROTROMBIN U ETIOLOGIJI PONOVLJENIH SPONTANIH POBAČAJA: PILOT STUDIJA
Iva PRUNER1, Valentina ĐORĐEVIĆ1, Maja GVOZDENOV1, Branko TOMIĆ1,
Mirjana KOVAC2,3, Predrag MILJIĆ2,4, Dragica RADOJKOVIĆ1
1Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo, Univerzitet u Beogradu, Beograd, Srbija
2Medicinski fakultet, Univerzitet u Beogradu, Beograd, Srbija
3Institut za transfuziju krvi, Centar za poremećaje hemostaze, Beograd, Srbija
4Klinika za hematologiju, Klinički centar Srbije, Beograd, Srbija
Izvod
Ponovljeni spontani pobačaji predstavljaju zdravstveni problem koji pogađa oko 5% žena u reproduktivnoj dobi. U etiologiju ovog oboljenja uključen je i veći broj trombofilnih faktora rizika. Cilj ove studije bio je da se utvrdi značaj nove genske varijante C20068T, locirane u 3’ kraju protrombinskog gena, za nastanak spontanih pobačaja. U studiju je uključeno ukupno 264 ispitanice, od čega 153 pacijentkinje sa ponovljenim spontanim pobačajima i 111 ispitanica kontrolne grupe, koje su testirane na prisustvo genske varijante C20068T.
U grupi pacijentkinja detektovana su četiri heterozigotna nosioca (2,61%) ove genske varijante, dok homozigotni nosioci nisu detektovani u ovoj studiji. U kontrolnoj grupi nije detektovan nijedan nosilac genske varijante C20068T. Naši rezultati pokazuju da postoji povećana učestalost genske varijante C20068T kod pacijentkinja sa ponovljenim spontanim pobačajima, ali razlika u učestalosti u odnosu na kontrolu grupu nije statistički značajna. Sa druge strane, učestalost genske varijante C20068T kod pacijentkinja koje su imale 5 i više spontanih pobačaja bila je statistički značajno povećana u odnosu na kontrolnu grupu (12,5% i 0%,respektivno, P=0,02).
Ovo je prva studija koja ističe značaj i moguću ulogu genske varijante C20068T u etiologiji spontanih pobačaja. Da bi se potvrdili rezultati ove pilot studije, potrebno je sprovesti dalja istraživanja koja obuhvataju veći broj ispitanica.
Autor za kontakt: Iva Pruner, Institut za molekularnu genetiku i genetičko inženjerstvo, Univerzitet u Beogradu, ,Vojvode Stepe 444a,P.O. Box 23; 11010 Beograd, Srbija,Phone: +381 11 3976658,Fax: +381 11 3975808,e-mail: iva.pruner@gmail.com
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 477-488
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
WENYANGBUSHEN-INDUKOVANA-EXPRESIJA VEGF, OPG, RANK I RANKL KOD KUNIĆA SA STEROID-INDUKOVANOM AVASKULARNOM NEKROZOM FEMORALNE GLAVE
Hongmei SONG1,2, Yingchen WEI2, Nan LI2, Bin WU1, Na XIE3, Heming WANG2,*
1 Odelenje interne medicije, Druga narodna bolnica, Fujian Univerzitet Tradicionalme kineske medicine, Fuzhou, Fujian, 350003, Kina.
2Fujian Univerzitet tradicionalne kineske medicine, Fuzhou, Fujian, 350122, Kina.
3 Halison međunarodna bolnica, Hengshui, Hebei, Kina.
Izvod
Vršena su ispitivanja efekata Wenyangbushen formule na mRNK i ekspresiju proteina f VEGF, OPG, RANK i RANKL kod steroid – indukovane avaskularne femoralne nekroze kod kunića (SANFH) i mogućnosti korišćenja potencijala mehanizma ove formule na tretman SANFH. Prikazani su rezultati različitih tretmana pet grupa kunića . Posle tretmana u toku osam nedelja ekspresija mRNK i proteina VEGF, OPG, RANK i RANKL u tkivu femoralne glave je određivana metodom RT-PCR za mRNK i Western blotting metodom za ekspresiju proteina. Dobijeni rezultati ukazuju da Wenyangbushen može efektivno da poboljša ćelije kostiju, osteoblasta i rast hondrocita kao i prevenciju apoptoze ćeelija kod SANFH. Ekspresija mRNK i ekspresija proteina OPG i VEGF je povećana dok su nivo RANK i RANKL bili redukovani u nekrotičnom tkivu model grupe u poređenju sa tkivom normalnih kunića. Wenyangbushen formula tretiranja može da ublaži nekrozu femoralne glave indukovane steroidima.
Autor za kontakt: Heming Wang, Fujian Univerzitet tradicionalne kineske medicine, Fuzhou, Fujian, 350122, Kina, E-mail: hemingwangfj@gmail.com
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 489– 498
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575:633.15
Originani naučni rad
PROCENA GENETIČKOG DIVERZITETA LINIJA KUKURUZA PRIMENOM
SSR MARKERA
Ana NIKOLIĆ, Dragana IGNJATOVĆ-MICIĆ, Dragan KOVAČEVIĆ, Zoran ČAMDŽIJA, Milomir FILIPOVIĆ, Snežana MLADENOVIĆ DRINIĆ
Institut za kukuruz „Zemun Polje“
Izvod
Stvaranje novih hibrida kukuruza sa većim potencijalom za prinos je stalna težnja programa oplemenjivanja svuda u svetu. Već postojeći i novi problemi koji se javljaju, a vezani su za različite biotičke i abiotičke stresove kao i rastuće potrebe svetskog tržišta zahtevaju stalan rad na pronalaženju novih rešenja za povećanje proizvodnje kukuruza. Tehnologija molekularnih markera je polje koje se brzo razvija, a primena dostignuća iz ove oblasti već je dala rezultate u rešavanju problema vezanih za unapređenje oplemenjivanja. Imajući u vidu navedeno, cilj ovog istraživanja bila je karakterizacija i utvrđivanje genetičke sličnosti 29 inbred linija kukuruza iz kolekcije Instituta za kukuruz primenom SSR markera. Analiza je urađena korišćenjem 20 parova SSR prajmera koji su dali jasno vidljive i reproducibilne rezultate. Detektovano je 119 alela, sa prosečnim brojem od 5.8 alela po lokusu. PIC (Polymorphism Information Content) vrednosti su bile u opsegu od 0.45 do 0.92 (srednja vrednost 0.74). Genetička sličnost između parova genotipova izračunata je korišćenjem Jaccard koeficijenta i kretala se u opsegu od 0.27 do 0.99. Grupisanje genotipova urađeno je primenom klaster i PCA (Principal Component Analysis) analize korišćenjem matrica genetičke sličnosti (NTSYS-pc softvera, verzija 2.1). Rezultati obe analize bili su u izvesnoj meri u saglasnosti sa pedigree podacima ispitivanih inbred linija kukuruza. Informacija o genetičkom diverzitetu inbred linija kukuruza detektovana primenom SSR markera može biti korisna u planiranju budućih strategija u programima oplemenjivanja.
Autor za kontakt: Ana Nikolić,Institut za kukuruz Zemun Polje, Slobodana Bajica 1, 11185 Beograd, Srbija. Tel: +381 11 3756 704, Fax: +381 11 3756 707, anikolic@mrizp.rs
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 499-507
© 2015 Društvo genetičara Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
GENERISANJE DIVALENTNE DNK VAKCINE ZASNOVANO NA p39 I shiga-like toxin 2 (stx2) GENU
Abbas DOOSTI1, Payam GHASEMI-DEHKORDI2*, Mohammad KARGAR3,
Abolghasem SHARIFI4
1 Centar za istraživanja u Biotehnologiji, Islamski Azad Univerzitet, Shahrekord ogranak Shahrekord, Iran
2 Centar za istraživanja ćelija i molekularna istraživanja, Shahrekord Univerzitet medicinskih nauka, Shahrekord, Iran
3 Odelenje za mikrobiologiju, Islamski Azad Univerzitet, Jahromogranak, Jahrom, Iran.
4 Shahrekord Univerzitet medicinskih nauka, Shahrekord, Iran
Izvod
U ovim ispitivanjima izvršeno je kloniranje stx2 i p39 gena u ekspresioni plazmid pEEF1D-FLAG (pcDNA 3.1+) kao kandidata za divalentnu vakcinu. Dobijeni su Enterohemorrhagic E. coli ATCC 3081 i vrsta umereno virulentnog soja B. melitensis i gajeni na specifičnim podlogama. Izolovana je bakterijska DNK iz kolonija i korišćena za umnožavanje p39 i stx2 gena amplificijom primenom PCR reakcije. Amplifikovani produkti su separisani na 2% agaroznom gelu i dobijeno je 285 odnosno 1220 fragmenata za stx2 i p39 gene. Svaki amplifikovani A/T gen kloniran je u pGEM-T vektor i pGEM-T-stx2 i pGEM-T-p39 su proizvedeni. Stx2 i p39 geni su subklonirani u linearizovan eksresioni vektor (pcDNA 3.1+) korišćenjem HindIII, XhoI i XbaI restrikcionih enzima i generisan je CDNA3-stx2-p39. Finalni konstrukt je potvrđen reakcijom PCR i digestijom. Rezultati pokazuju da su reakcije bile uspešne. Prema dobijenim rezultatima dobijen je novi recombinantni pcDNA 3.1+-stx2-p39 konstrukt koji može da bude koristan kao kandidat DNA vakcine kod animalnih sistema prema ispitivanim sojevima patogena.
Autor za kontakt Payam Ghasemi-Dehkordi,,, Centar za istraživanja ćelija i molekularna istraživanja, Shahrekord Univerzitet medicinskih nauka, Shahrekord, Iran
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 509 -522
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575.633
Originani naučni rad
INTERPRETACIJA INTERAKCIJE GENOTIP × SPOLJAŠNJA SREDINA KOD ENGLESKOG LJULJA (Lolium perenne L.)
Željko LAKIĆ1, Igor BALALIĆ2, Svetko VOJIN1
1Poljoprivredni institut Republike Srpske, Banja Luka,
Republika Srpska - BiH
2Institut za ratarstvo i povrtarstvo, Novi Sad, Srbija
Izvod
Cilj ovog istraživanja bio je da se proceni interakcija genotip × godina za dužinu klasa, masu 1000 semena, broj semena po g i hektolitarsku masu kod engleskog ljulja, koristeći osam divergentnih genotipova gajenih tokom dve vegetacione sezone. Interakcija je ocenjena primenom AMMI (metod aditivnih glavnih efekata i višestruke interakcije) modela. Za sve osobine utvrđene su aditivne (genotip, godina) i ne aditivne (interakcija genotip × godina) varijacije. Na osnovu rezultata AMMI1 biplota genotip G4 pokazao je najveću stabilnost za sve ispitivane osobina, tako da se može preporučiti za setvu u različitim uslovima sredine. Takođe, genotip G4 može se koristiti i u stvaranju novih domaćih sorti engleskog ljulja.
Autor za kontakt: Željko Lakić, Poljoprivredni institut Republike Srpske, Banja Luka,Republika Srpska - BiH
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 523– 534
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
KLASIFIKACIJA MIKROZONA EKSPRESIJE GENA PRIMENOM ELM
(EXTREME LEARNING MACHINE)
M. YASODHA1*, P. PONMUTHURAMALINGAM1
1 Državni fakultet umetnosti (samostalan) Coimbatore, Tamilnadu, Indija
Izvod
U pretdsavljenom scenariju je opasna bolest, kancer. On se širi kroz krv ili limfu na druge lokacije u telu i pretstavlja set ćelija koje se dele nekontrolisano, napadaju i razaraju susedna tkiva i dolazi do pojave metastaza. U dijagnozi kancera i molekularnoj biologiji korisna efektivna analiza je mikrozona DNK. Dominantnost ove tehnike je prepoznata ali proizilazi nekoliko nedoumica koje se odnose na pravilnu analizu podataka mikrozona. U oblasti medicinskih nauka klasifikacija multikategorija igra veoma važnu ulogu. U cilju prevazilaženja problema klasifikacija kancera u multikategotije korišćen je poboljšan ELM klasifikator (Extreme Learning Machine). Diskutovani su dobijeni rezultati.
Autor za kontakt: M. Yasodha, Državni fakultet umetnosti (samostalan) Coimbatore, Tamilnadu, Indija. E-Mail: yasodhamii@gmail.com
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2(2015), str: 535– 548
© 2015Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
ISPITIVANJA FLUKTUIRAJUĆE ASIMETRIJE (FA) ZA NEKE MOFOLOŠKE OSOBINE KOD ČETIRI VRSTE Drosophila bipectinata KOMPLEKSA
Parul BANERJEE and Bashisth Narayan SINGH*
Laboratorija za Genetiku, Odelenje za Zoologiju,, Banaras Hindu Univerzitet Varanasi 221005, Indija
Izvod
Razlike u nivou fluktuirajuće asimetrije (FA) kod drozofile mogu da se koriste za poređenje precoznost razvoja među blisko srodnim vrstama i da daju ideju da li je bilo uticaja na stabilnost razvića u toku divergencije i separacije populacija u različite vrste. Vršena su ispitivanja kod četiri vrste Drosophila bipectinata complex i.e. D. bipectinata, D. parabipectinata, D. malerkotliana i D. pseudoananassae.. U slučaju muških jedinki FA je varrao značajno kod dužine krila, (WL) i SCTN ( sex comb tooth number). Dok su kod ženskih jedinki CFA (Composite fluctuating asymmetry) nije pokazano značajno variranje, kod muških jedinki je utvrđeno vrlo znaajno variranje između vrsta. Bonferroni t- testovi nisu potvdili bilo koju konzistentnu razliki u nivou FA između bilo koje dve vrste. Za magnitude FA je utvrđeno da se značajno razlikuju od osobine do osobine a vrednosti CFA utvrđene su više kod muških nego ženskih jedinki kod sve četiri ispitivane vrste. Na osnovu dobijenih rezultata može da se zaključi da nivo FA pokazuje specifično variranje i kod ženki a muške jedinke su više sklone razvojnim promenama. Nivo FA je manje ili više sličan kod sve četiri ispitivane vrste ovog kompleksa. Tako da preciznost razvića ostaje skoro ista kod svih ispitivanih vrsta bez obzira na dostignuti stepen evolucione divergentnosti.
Autor za kontakt: R. Darvishzadeh, Odeljenje za oplemenjivanje i biotehnologiju, Urmia Univerzitet, Urmia, Iran. E-mail: r.darvishzadeh@urmia.ac.ir. Phone: + 98 914 9734458. Fax: + 98 44 32779558
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2(2015), str: 549 – 558
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575:633
Originani naučni rad
DETERMINACIJA NAJBOLJIH INDIREKTNIH SELEKCIONIH KRITERIJUMA KOD IRANSKI GENOTIPOVA TVRDE PŠEICE (Triticum aestivum L.) U USLOVIMA NAVODNJAVANJA I STRESA SUŠE
Ahmad Reza GOLPARVAR1*, Mohammad Mehdi GHEISARI2, Davoud NADERI3, Ali Mehras MEHRABI4, Amin HADIPANAH5, Saeed SALEHI6
1- Odelenje za poljoprivredu i oplemenjivanje biljaka,Department za poljoprivredu i oplemenjivanje bilajka, Poljoprivredni fakultet, Isfahan (Khorasgan) Branch, Islamski Azad Univerzitet, Isfahan, Iran
2- Odelenje za hemiju, Isfahan (Khorasgan) odeljak, Islamski Azad Univerzitet, Isfahan, Iran
3- Odelenje za hortikulturu, Poljoprivredni fakultet, Isfahan (Khorasgan) odeljak, Islamski Azad Univerzitet, Isfahan, Iran
4- Odelenje za oplemenjivanje biljaka, Kermanshah ogranak, Islamski Azad Univerzitet, Kermanshah, Iran
5- Odelenje za hortikulturu, Odeljak za nauku i sitraživanja, Islamski Azad Univerzitet, Teheran, Iran
6- Odelenje za poljoprivredu, Poljoprivredni fakultet , Sanandaj odeljak, Islamski Azad Univerzitet, Sanandaj, Iran
Izvod
Izvršena je klasifikacija morfoloških i morfo-fizioloških osobina kod 200 genotipova tvrde pšenice u uslovima suše i navodnjavanja 200 genotipova durum pšenice u toku sezone gajenja 22014-2015. Rezultati su dobijeni u dva ponavljanja u uslovima suše i dva ponavljanja u uslovima navodnjavanja. Faktorijalna analiza bazirana na analizi osnovnih komponenata i varimaks rotaciji ukazuje da četiri značajna faktora određuju 87 odnosno 92 procenta ukupnog variranja između osobina u uslovima suše i navodnjavanja.U uslovima stresa prinos po klasu i njegove komponente učestvuju u ukupnom variranju sa 37 procenata i značjno su vezani za sa prinsom i njegovim komponentama. Prinos semena po biljci, gustina klasa i faktori transmisijee asimilata su odgovorni za 22, 16 i 12 procenata variranja. U uslovima navodnjavanja prvi faktor utiče na 36 procenata ukupnog variranja i značajno je vezan sa osobinama biljaka i prinosa semena po klasu, žetveni indeks biljke i klasa, broj zrna po klasu i visinu biljke. Ovaj faktor je vezan za prinod semena po biljci. Produkcija, transmisija asimilata i gustina klasa su odgovorni za 24, 18 i 14 procenata variranja.
Autor za kontakt: Ahmad Reza Golparvar,Odelenje za poljoprivredu i oplemenjivanje biljaka,Department za poljoprivredu i oplemenjivanje bilajka, Poljoprivredni fakultet, Isfahan (Khorasgan) Branch, Islamski Azad Univerzitet, Isfahan, Iran
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 559-570
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575:633
Originani naučni rad
KOMBINACIONA SPOSOBNOST I NASLEDNOST SELEKCIONISANIH SORATA PIRINČA NA PRINOS ZRNA, KOMPONENTE PRINOSA I KARAKTERISTIKE KVALITETA ZRNA
Mehrzad ALLAHGHOLIPOUR 1*, Ezatollah FARSHDFAR 2, Babak RABIEI 3
1 Odelenje za oplemenjivanje biljaka, Istraživački Institut za pirinač u Iranu ( RRII) Rasht, Iran
2 Odelenje za poljoprivredu i oplemenjivanje biljaka, Fakultet poljoprivrednih nauka, Univerzitet Razi, Kermanshah, Iran
3 Odelenje za poljoprivredu i oplemenjivanje biljaka, Fakultet poljoprivrednih nauka, Univerzitet, Rasht, Iran.
Izvod
Vršena su ispitivanja kombinacione sposobnosti i naslednost prinosa zrna, komponenti prinosa, sadržaj amiloze (AC), temperatura želatinizacije,, konzistentnost gela (GC) i oporavak glave pirinča (HRR). Ukrštanja su vršena u otpunom dialelnom dizajnu. Sledeće sezone vršena su recipročna ukrštanja. Ukrštene, recipročne i roditeljske linije su zasejane u kompletnom blok sistemu u tri ponavljanja. Analiza varijanse je pokazala da su se svi genotipovi značajno razlikovali u svim ispitivanim osobinama Dialelna analiza po Grifingu je pokazala visoko značajne razlike u GCA, broju klasova po biljci (PN), sadržaju amiloze (AC), temperaturi želatinizacije i oporavak glave pirinča. Dobijeni rezultati ukazuju da selekcija u ranim generacijama može da se vrši za fiksiranje poželjnih gena.
Autor za kontakt: Mehrzad Allahgholipour, Odelenje za oplemenjivanje biljaka, Istraživački Institut za pirinač u Iranu (RRII), P.O Box: 1658, Postal Code: 41996-13475, Rasht, Iran,Email address: alahgholipour@yahoo.com Tel: 098-133-6690052, Fax: 098-133-6690051
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 571-580
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575:630
Originani naučni rad
ANALIZA UNUTARPOPULACIONOG VARIJABILITETA TAKSODIJUMA
(Taxodium distichum L. Rich.) U SEMENSKOJ SASTOJINI KOD BAČKE PALANKE UPOTREBOM RAPD MARKERA
Vladan POPOVIĆ1), Aleksandar LUČIĆ2), Danijela RISTIĆ2), Ljubinko RAKONJAC1), Sabahudin HADROVIĆ3), Snežana MLADENOVIĆ-DRINIĆ2)
1Institut za šumarstvo, Beograd, Srbija
2Institut za kukuruz, Zemun Polje, Beograd, Srbija
Izvod
U radu su prikazani rezultati ispitivanja unutarpopulacione varijabilnosti taksodijuma u semenskoj sastojini kod bačke palanke upotrebom RAPD markera. RAPD analiza je urađena na 20 test stabala sa 13 prajmera. Koeficijenti genetičke sličnosti izračunati po Dice-u, a na osnovu njih su konstruisani grafikoni klaster i korespodencione analize.
Dobijeni rezultati analize genetičke karakterizacije test stabala primenom RAPD markera pokazuju izraženu genetičku varijabilnost, koja je uslovljena visokim stepenom heterozigotnosti. Genetska sličnost između test stabla izračunata po Dice-u kretala se od 0,73 (11 - 14) do 1 (2 - 12, 2 - 18, 12 - 18, 12 – 15, 15 - 18), dok je srednja vrednost bila 0,87. Analizom grafikona klaster i korespodencione analize može se zaključiti da se test stabla grupišu na sličan način. Test stabla broj 2, 12, 15 i 18 su genetički najsličnija.
Zadovoljavajući stepen genetičke varijabilnosti između proučavanih test stabala predstavlja dobru polaznu osnovu za dalji proces oplemenjivanja vrste i usmereno korišćenje raspoloživog genofonda.
Autor za kontakt: Vladan Popović, Institut za šumarstvo, Kneza Višeslava 3, Beograd, Srbija
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 581-598
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
EVALUACIJA KOMPONENATA PRINOSA SUNCOKRETA POD RAZLIČITIM USLOVIMA STRESA NEDOSTATKA VODE
Esmaeel GHOLINEZHAD1, Reza DARVISHZADEH2, Iraj BERNOUSI2
1 Odelenje za poljoprivredu, Payame Noor Univerzitet, Tehran, Iran.
2 Odelenje za oplemenivanje i biotehnologiju, Urmia Univerzitet, Urmia, Iran
Izvod
Vršena su ispitivanje prinosa i komponenata prinosa 56 sorata suncokreta u uslovima deficita vode u Istraživačkom centru za poljoprivredu Zapadnog Azerbejdžana u sezonama 2012 – 2013. Tesstiranja su vršena u optimalnim uslovima navodnjavanja, umerenog i jakog stresa suše posle potpuno strošenih 50%. 70% i 90% dostupnih zaliha vode. Utvrđeno je da su pojedinačni i kombinovani efekti tretmana i genotipa na ispitivane osobine bili značajni. Povećanjem intenziteta stresa prinos zrna, odnos zrna i prinosa, broja zrna po glavi, prečnik glave, težina 1000 zrna, i biološki i prinos i žetveni indeks su smanjeni dok je procenat udubljenja glave povećan. Na svakom nivou stresa reakcija genotipoa je bila različita tako da je moguće izvršiti izbor genotipova za gajenje u različitim uslovima.
Autor za kontakt: Esmaeel Gholinezhad, Odelenje za poljoprivredu, Payame Noor Univerzitet, Tehran, Iran,E-mail: holinezhad1358@yahoo.com,Phone: +98441,Fax: + 98441
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015),
str: 599-608
© 2015 Društvo genetičara Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575.630
Originani naučni rad
RAZVIJANJE SISTEMA ZA ADVENTIVNU ORGANOGENEZU I REGENERACIJU TRANSGENIH BILJAKA KUPINE
Alena GAJDOŠOVÁ1*, Tatjana VUJOVIĆ2, Miroslava SÚKENÍKOVÁ1, Gabriela LIBIAKOVÁ1
1Institut za bilјnu genetiku i biotehnologiju, Slovačka Akademija nauka, Nitra, Republika Slovačka
2Institut za voćarstvo, Čačak, Republika Srbija
Izvod
Unošenje strane DNK u genom biljaka posredstvom Agrobacterium tumefaciens je obećavajuća tehnika ciljanog transfera gena koja je međutim zavisna od efikasnog sistema za regeneraciju. Cilj ovoga rada je bio da se uspostavi sistem za efikasnu adventivnu organogenezu i regeneraciju transgenih biljaka Rubus fruticosus L. korišćenjem eksplantata uzetih sa zrelih biljaka. Regeneracija potencijalno transgenih izdanaka je ostvarena iz eksplantata koje su sačinjavale lisne drške sa bazalnim delom lisne ploče, i koji su vertikalno postavljeni i inicijalno gajeni na MS medijumu sa 1 mg l-1 TDZ i 0,02 mg l-1 IBA. Eksplantati su posle transformacije posredstvom bakterije A. tumefaciens soj LBA 4404 koja nosi plazmid pCambia 1304 transplantirani na MS medijum koji je sadržavao 1 mg l-1 BAP, 0,02 mg l-1 IBA, 0,1 mg l-1 GA3 i 10–15 mg l-1 hygromicina. Četiri potencijalno transgene biljke sorte ‘Čačanska Bestrna’ su uspešno ožiljene i aklimatizovane.
Autor za kontakt: Alena Gajdošová, 1Institut za bilјnu genetiku i biotehnologiju, Slovačka Akademija nauka, Akademická 2, P.O. Box 39A, SK-950 07 Nitra 1, Republika Slovačka, tel: +421 37 6943 315; fax: +421 37 733 66 60; e-mail: alena.gajdosova@savba.sk
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015),
str: 609-616
© 2015 Društvo genetičara Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
ZNAČAJ DETEKCIJE MUTANTA GENA MTHFR KOD PACIJENATA
SA PONAVLJUĆIM POBAČAJIMA
Klaudija DAUGĖLAITĖ1, Danielius SERAPINAS1,2
1 Odelenje pulmologije i imunologije, Medicinska Akademija, Litvanski Univerzitet za nauke o zdravlju, Kaunas, Litvanija
2Mikolas Romeris Univerzitet, Vilnius, Litvanija
Izvod
Homocisteine (methylenetetrahydrofolate reductase) je enzim pod kontrolom MTHFR gena lociranog na hromozomu 1. Mutacija u MTHFR genu može rezultirati u promeni metabolizma homocisteina i povećati rizik pobačaja. U nekim slučaevima poremećaj trudnoće može da se spreči davanjem folne kiseline i B grupe vitamina. Sekvenciranje MTHFR gena da se utvrdi mutacija obično je previđena od stane lekara i genetičkog savetovališta. Da bi se rasvetlio problem vršena su ispitivanja slučaja rekurentnog pobačaja kod pacijenta sa homozigotnom c. 655C>T promenom MTHFR gena.
Autor za kontakt: Danielius Serapinas, Odelenje pulmologije i imunologije, Medicinska Akademija, Litvanski Univerzitet za nauke o zdravlju, Eivenių st. 2, Kaunas LT-50009, Litvanija, Email: dserapinas@gmail.com, tel +37061490479 , fax +37037326953
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2014), str: 617-626
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575.633
Originani naučni rad
ADAPTIVNA REAKCIJA VRSTA PAMUKA G. hirsutum ,L. i G. barbadense L.
NA STRES SUŠE
Afet MAMMADOVA1, Ramiz ALIYEV1, Sevda BABAYEVA1, Mehraj ABBASOV1,2
1 Institut za genetčke resurse Nacionalne Akademije Nauka, Azerbejdžan, AZ1106, Baku, Azerbaijan
2 Baku državni Univerzitet, AZ1048, Azerbaijan
Izvod
Vršena su ispitivanja adaptacionog potencijala kolekcije od 267 genotipova i sorata unutar i između vrsta pamuka ( 197 uzoraka G. hirsutum L. i 70 G.barbadense L.).Uporedna ispitivanja reakcije na stress vršena sun a osnovu stress depresionih indeksa vijabilnosti semena na rastvoru saharoze koji su imitirali uslove stresa. Dati su rezultati ispitivanja različite osetljivosti na abiotički stress. Amplitude promena unutar svake vrste definisanjem različitih stepena fizioloških parametara u toku stresa dopuštaju podelu genotipova pamuka unutar svake grupe prema stepenu komparativne otpornosti na stress. Otkrivene su razlike između G. hirsutum L. I G. barbadense L. na osnovu analize procenta visoko rezistentnih uzoraka na stress unutar vrsta.Kod G. hirsutum L. provcenat uzorka sa visokom rezistencijom na sušu je bio 9.1% a kod vrste G. barbadense L.-28.6% što ukazuje da ova vrsta ima veeći potencijal za aklimaticaziju na nove uslove, sposobnost bolje toleratnosti štetnih efekata suše I velili potencijal za oplemenjivanje. Utvrđeno je da se u toku stresa kod otpornih vrsta vrši aktivacija sinteze RNK i smanjenje stabilne DNK što ukazuje na aktivnost genetičkog aparata. Kod osetljivih vrsta je utvrđena redukcija sinteze RNK I DNK.
Autor za kontakt: Mehraj Abbasov, Institut za genetčke resurse Nacionalne Akademije Nauka, Azadliq Ave 155, AZ1106, Baku, Azerbaijan, e-mail: mehraj_genetic@yahoo.com
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 627-638
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
DETEKCIJA GENA ZA PRODUKCIJU TOKSINA I RAPD ANALIZA Bacillus cereus IZOLATA IZ RAZLIČITIH TIPOVA ZEMLJIŠTA
Dejana SAVIC1, Dragana JOSIC2, Elizabeta RISTANOVIC1, Radmila PIVIC3,
Aleksandra STANOJKOVIC-SEBIC3, Zorica LEPSANOVIC4
1Institut za mikrobiologiju, VMA, Beograd
2 Odeljenje za mikrobiologiju, Geentička laboratorija, Institut za zemljište, Beograd
3Odeljenje za melioraciju i eroziju zemljišta, Institut za zemljište, Beograd
4Institut za epidemiologiju, VMA, Beograd
Cilj rada bio je da se detektuju geni za toksine B. cereus izolata: entero- (hbla, entFM i bceT) i emetični toksin (cer), da se utvrdi osetljivost na antibiotike i detektuje raznolikost genoma između izolata B. cereus, RAPD analizom. Primenom klasičnih mikrobioloških metoda i PCR, B. cereus je identifikovan kod 12 od 117 uzoraka Bacillus spp. Svi izolati su bili rezistentni na penicilin i ampicilin, dva na tetraciklin i četiri na trimetoprim-sulphamethokazole. Takođe, svi izolati su produkovali penicilinaze i β-lactamaze. Geni za produkciju toksina su detektovani PCR metodom. EntFM i cer geni bili su prisutni u svim izolatima, hbla nije detektovan kod dva, a bceT ni u jednom izolatu. RAPD analiza je izvedena upotrebom četiri prajmerima, od kojih su dva dizajnirana za ovu studiju. Dobijeno je 10 različitih profila na nivou sličnosti od 90%. Izolati su grupisani u dva klastera nezavisno od tipa zemljišta ili načina upotrebe zemljišta. Prisustvo gena koji kodiraju toksine u svim B. cereus izolatima ukazuje da su ove bakterije potencijalno patogene i opasne po zdravlje čoveka. RAPD analiza je pokazala visoku heterogenost unutar vrste B. cereus kod naših izolata, bez obzira na tip ili upotrebu zemljišta. Po našem saznanju, ovo je prva studija koja analizira prisustvo gena za toksine i heterogenost genoma kod B. cereus izolata iz različitih tipova zemljišta u Srbiji.
Autor za kontakt: Dejana Savic, Department of Microbiology, Military Medical Academy, Crnotravska 17, 11000 Belgrade, Serbia, Tel(+381) 11 3609404, Fax(+381) 11 2666164, e-mail dejsav@yubc.net
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47,
broj 2 (2015), str: 639-650
© 2015 Društvo genetičara Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
.
UDC 575.633.25
Originani naučni rad
PROCENA TOLERANTNOSTI NA SUŠU NOVIH GENOTIPOVA KUKURUZA ŠEĆERCA U BUGARSKOJ PRIMENOM POKAZATELJA TOLERANTNOSTI
NA STRES
Lydia Shtereva, Roumiana Vassilevska-Ivanova*, Boris Kraptchev
Odelenje za Primenjenu Genetiku i Biotehnologiju , Institut za biljnu Fiziologiju i Genetiku, Bugarska akademija Nauka, Sofija, Bugarska
Izvod
Vršena su ispitivanja dve samooplodne linije kukuruza šećerca i heterotični efekat u F1 hibridu njihovim ukrštanjem (Zea mays L. var. rugosa Bonaf.). u cilju ocenivanja njihove reakcije na na stress prem izazvan vodom u prisustvu PEG-a.u fazi klijanaca. Pokazatelji stresa su ocenjivani prema uticaju stresa na neke od fizioloških i biohemijskih osobina. Vodni potenijali su bili nula (0) kod kontrole i -0.6, -0.9, -1.2 i -1.5 MPa kod trertmana . Vršena su merenja sadržaja prolina,, malondialdehida i vodonik peroksida kao parmetara koji određuju stress.. U uslovima stresa klijanje semena je bilo obrnuto proporcijalno koncentraciji Polietilen glikola (PEG) kod svih ispitivanih genotiova kod dužine korena i biljke a došlo je do smanjenja sadržaja sveže i suve mase sa povećajem koncentracije politilen glikola u poređenju sa kontrolom. Došlo je do povećanja sadržaja Malonil aldehida, prolina i vodonik peroksida pri različitim osmotskih gradijenata u poređenju sa kontrolom. Dobijeni rezultati uazuju da se samooplodna linija C -6 može koristiti kao obećavajućaroditeljska linija u stvaranju hibrida kukuruza šećerca tolerantnih na uslove stresa suše. Ovi rezultati se mogu smatrati preliminarnim i potrebno je u istraživanja uključiti veći broj samooplodnih linija i hibrida.
.
Autor za kontakt: Roumiana Vassilevska-Ivanova, Odelenje za Primenjenu Genetiku i Biotehnologiju, Institut za biljnu Fiziologiju i Genetiku, Bugarska akademija Nauka, 1113 SofiJa, Bugarska; Phone: +359 2 9746229; E-mail: ru_vas_bg@yahoo.com
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 651-663
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575.630
Originani naučni rad
DETEKCIJA I MOLEKULARNA KARAKTERIZACIJA VIRUSA BLAGOG ŠARENILA PAPRIKE (Pepper mild mottle virus) U SRBIJI
Dragana MILOŠEVIĆ1, Ivana STANKOVIĆ2, Aleksandra BULAJIĆ2, Maja IGNJATOV1,
Zorica NIKOLIĆ1, Gordana PETROVIĆ1, Branka KRSTIĆ2
1Institut za ratarstvo i povrtarstvo, Novi Sad, Srbija
2Univerzitet u Beogradu, Poljoprivredni fakultet, Beograd, Srbija
Izvod
Tokom 2009 i 2010, sprovedeno je ispitivanje prisustva virusa blagog šarenila paprike (Pepper mild mottle virus, PMMoV) u usevima paprike u Srbiji. Ukupno 239 uzoraka paprike iz 39 useva sa 26 lokaliteta je prikupljeno i serološki testirano na prisustvo PMMoV, virusa mozaika krastavca (Cucumber mosaic virus, CMV), virusa crtičastog mozaika krompira (Potato virus Y, PVY) i virusa mozaika lucerke (Alfalfa mosaic virus, AMV), korišćenjem komercijalno dostupnih kitova za DAS-ELISA test. Iako je otkriven u malom procentu, PMMoV bi mogao predstavljati ozbiljnu pretnju proizvodnji paprike u Srbiji, s obzirom na to da se lako prenosi putem semena. Prisustvo PMMoV je potvrđeno serološkom i biološkom detekcijom, kao i primenom RT-PCR metode korišćenjem specifičnih prajmera za RNA-zavisnu RNA polimerazu i gen za protein omotača (CP gen). Molekularnom identifikacijom potvrđeno je da srpski izolati pripadaju PMMoV, patotipu P1,2, koji nije u mogućnosti da prevaziđe otpornost gena L3. Filogenetsko stablo potvrdilo je grupisanje srpskih izolata zajedno sa većinom izolata koji pripadaju patotipu P1,2. Obavljena istraživanja pružaju prve informacije o serološkoj i molekularnoj karakterizaciji virusa blagog šarenila paprike poreklom iz paprike u Srbiji, pružajući važne podatke o strukturi populacije. Dobijeni podaci mogu imati velik uticaj na proizvodnju paprike u Srbiji, a takođe i velik značaj u budućem oplemenjivačkom radu na selekciji otpornih genotipova paprike.
Autor za kontakt: Dragana Milošević, Institut za ratarstvo i povrtarstvo, Makima Gorkog 30, 21000 Novi Sad, SrbiJa, phone:+381 21 4898155, fax:+381 21421249, E-mail: dragana.milosevic@nsseme.com
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 665-677
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
EVOOLUCIJA RASTA HIPOTALAMUS - PITUITARI OSOVINE RIBE, AMFIBIJE, PTICA I ŽIVOTINJA
M. MOAEEN-UD-DIN1þ, G. BILAL1 i James M. REECY2
1Laboratorije za oplemenjivnje i genetiku fakulteta za Veterinu i nauku o životinjama, PMAS-Arid poljoprivredni Univerzitet, Rawalpindi (46300), Pakistan
2 Odeljenje animalne nauke, Ajova Državni univerzitet, Ames, SAD
Izvod
Rast HP – osovine reguliše rast životinja i razvoj u prenatalnom i post natalnom životu, kojim upravljaju brojni faktori. Međutim, do skoro istorija evolucije osovine među rodovima još nije razjašnjena. Diverzitet između Homo sapience, Mus musculus, Rattus norvegicus, Gallus gallus, Danio rerio i Xenopus laevis je determinisan ispitivanjima gena uključenih u kontrolu rasta osovine HP. Sekvence gena rasta osovine HP su dobijene iz baze sekvenci - NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/. Diverzitet nukleotida je određivan dvoparmetarskom metodom Kimura-e : kodon – zasnovan test selekcije korišćenjem kodon – zavisnim testom pozitivne selekcije Nei-Gojobori; istovetnost evolucione brzine je određivanjem Tajima's testom, a relativne brzine i filogenetska istorija su determinisani u MEGA6. Procena koeficijenta evolucione diferencijacije zasnovana na substituciji nukleotida i način substitucije aminokiselina kod gena rasta osovine HP je pokazala kontrastni način evolucije među rodovima. Rezultati su pokazali da, iako ti geni mogu da imaju ključnu funkcionalnu ulogu u svakoj od tih vrsta, njihova divergentnost sekvenci ne odražava obavezno sličnu molekularnu evoluciju među vrstama. Detaljni rezultati ukazuju da mutageni procesi koji generišu substitucione mutacije učestvuju u apromaksitivno istoj brzini u sinonimnim i nesinonimnim mestima tih rodova. Šta više, uprkos zajedničkom pretku utvrđeno je različito vreme divergencije među genima tih rodova. Ovo je prva demostracija da različite brzine molekularne evolucije mogu biti prisutne unutar gena koji kontrolišu brzinu rasta osovine HP. Ove razlike mogu da budu od interesa za komparativne genomske analize vrsta i fiziološke funkcije gena kod kojih nije dovoljno istražena osovina rasta HP.
Autor za kontakt: Muhammad Moaeen-ud-Din, 1Laboratorije za oplemenjivnje i genetiku fakulteta za Veterinu i nauku o životinjama,PMAS-Arid Poljoprivredni Univerzitet, Rawalpindi (46300), Pakistan, Email: drmoinawan@gmail.com,Ph: 0092-3438702053
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015),
str: 679-694
© 2015 Društvo genetičara Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575:630
Originani naučni rad
ODGOVOR GENOTIPOVA Iris variegata NA RAZLIČITE SVETLOSNE USLOVE: FENOLOGIJA CVETANJA I REPRODUKTIVNI USPEH
Uroš ŽIVKOVIĆ, Danijela MILJKOVIĆ, Nataša BARIŠIĆ KLISARIĆ, Aleksej TARASJEV, Stevan AVRAMOV
Odeljenje Evolucione Biologije, Institut za Biološka Istraživanja ”Siniša Stanković”, Univerzitet u Beogradu, Beograd, Srbija
Izvod
U ovom radu analizirali smo genetičku varijabilnost i fenotipsku plastičnost osobina cvetanja i reproduktivnog uspeha kod 97 genotipova Iris variegata koji nastanjuju različita svetlosna staništa u Deliblatskoj Peščari. Delovi rizoma ovih genotipova su presađeni u eksperimentalnu površinu pored Instituta za biološka istraživanja u Beogradu i gajeni u dva eksperimetalna svetlosna tretmana. Statistički značajne razlike između genotipova su uočene za dve osobine: početak cvetanja i prosečno vreme cvetanja. Genotipovi I.variegata koji potiču iz dva različita staništa u Deliblatskoj Peščari se razlikuje za tri osobine: broj cvetova, odnos broja čaura i broja cvetova i mase semena po čauri. Značajan efekat svetlosnog tretmana je takođe uočen kod tri osobine: odnos broja čaura i broja cvetova, mase semena po čauri i prosečne mase semena. Fenotipske korelacije između ovih osobina cvetanja i plodonošenja su bile generalno slične ali su pokazivale i zavisnost od svetlosnog tretmana kao i od porekla genotipova (tipa staništa). Poredeći rezultate ovog istraživanja sa podacima dobijenim na srodnoj vrsti uočeno je da neke osobine pokazuju slične odgovore ali da takođe postoje značajne razlike u nekim od osobina koje opisuju cvetanje i plodonošenje.
Autor za kontakt: Stevan Avramov, Odeljenje Evolucione Biologije, Institut za Biološka Istraživanja ”Siniša Stanković”, Univerzitet u Beogradu, Beograd, 11000 Srbija, tel. +381 11 2078376, fax: +381 11 761433; e-mail: stevan@ibiss.bg.ac.rs
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 695-710
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
ISPITIVANJE POJEDINAČNIH NUKLEOTIDNIH POLIMORFIZAMA U 52 GENA UKLJUČENA U DNK REPER I KONTROLU ĆELIJSKOG CIKLUSA KOD PACIJENATA OBOLELIH OD FANKONIJEVE ANEMIJE
Sandra PETROVIĆ1, Andreja LESKOVAC1, Ivana JOKSIĆ1,2, Dragana VUJIĆ3, 4,
Ana Valenta ŠOBOT1, Jelena FILIPOVIĆ1 and Gordana JOKSIĆ1
1 Institut za nuklearne nauke Vinča, Univerzitet u Beogradu, Beograd, Srbija
2Ginekološko akušerska klinika “Narodni front”, Beograd, Srbija
3Medicinski fakultet, Univerzitet u Beogradu, Beograd, Srbija
4Institut za zdravstvenu zaštitu majke i deteta Srbije "Dr. Vukan Čupić", Beograd, Srbija
Izvod
Fankonijeva anemija (FA) je genetički heterogeno oboljenje koje se manifestuje progresivnom pancitopenijom, razvojnim abnormalnostima i predispozicijom ka razvoju kancera. Nezavisno od mutacija u FANC genima koje su direktni uzročnici bolesti, identifikacija varijacija u DNK, naročito pojedinačnih nukleotidnih polimorfizama u odabranim genima, može omogućiti individualizaciju pristupa svakom pacijentu i poboljšati prognozu bolesti. U ovom istraživanju, ispitali smo 95 pojedinačnih nukleotidnih izmena lociranih u 52 ključna gena uključena u bazni ekscizioni reper, nukleotidni ekscizioni reper,“ mismatch“ reper, reper dvolančanih prekida DNK, kao i u nekoliko gena odgovornih za kontrolu ćelijskog ciklusa i apoptoze. Istraživanjem su obuhvaćena pet FA-D2 pacijenta i jedan FA-A pacijent, a genotipizacija polimorfizama je izvršena pomoću DNK reper čipa (Asper Biotech). Proučavani su sinonimni (n=10) i nesinonimni (“missense“) polimorfizmi (n=52), kao i polimorfizmi u nekodirajućim regionima genoma (introni i 5‘ i 3’ netranslatorni regioni) (n=33). Rezultati našeg istraživanja pokazuju da se pacijenti međusobno razlikuju po tipu i po broju nukleotidnih polimorfizama i istovremeno ukazuju na potrebu daljeg ispitivanja polimorfizama lociranih u genima ATM, APEX APE 1, XRCC1, ERCC2, MSH3, PARP4, NBS1, BARD1, CDKN1B, TP53 and TP53BP,1 na većem broju pacijenata, što bi omogućilo bolji uvid u kliničku sliku bolesti. Pored toga, pokazano je da pojedinačni nukleotidni polimorfizmi mogu imati značajnu ulogu u predikciji kancera kod FA pacijenata, kao i u proceni efikasnosti i toksičnosti različitih vidova terapije.
.
Autor za kontakt: Sandra Petrovic, Institut za nuklearne nauke Vinča, Univerzitet u Beogradu,M. Petrovica Alasa 12-14, 11001 Beograd, Srbija,Phone: +381 11 340856,Email1: sandra@vinca.rs
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 711-722
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575:630
Originani naučni rad
MOLEKULARNO I MORFOLOŠKO VARIRANJE NEKIH GENOTIPOVA
IRANSKOG ŠAFRANA (Crocus sativus L.)
F. Izadpanah 1,*, S. Kalantari 1, M. E. Hassani 2, M. R. Naghavi 3, M. Shokrpour1
1 Odelenje za hortikulturu, Poljoprivredni fakultet, Univerzitet u Teheranu, Karaj 31587, Iran
2 Poljoprivredni fakultet, hrana i prirodni resursi, Univerzitet u Sidneju, Australija
3 Odelenje za oplemenjivanje biljaka, Poljoprivredni fakultet, Univerzitet u Teheranu, Iran
Izvod
Šafran (Crocus sativus L.) je najskuplji začin u svetu. Perenialne vrste pripadaju porodici Iridaceae. Vršena je preliminarna evaluacija morfološke i molekularne divergentnosti između 29 genotipova šafrana iz Irana u dužini i broju listova, površine lista, sveža i suva masa lista . Korišćeni su RAPD markera sa 17 prajmera za ocenu molekularne divergentnosti između genotipova. Analizom jednostavne korelacione analize utvrđene su signifikantne pozitivne korelacije među morfološkim osobinama ali negativne korelacije između vremena nicanja i drugih karakteristika. Analiza dendograma zasnovanih na morfološkim i molekularnim podacima daju različite grupe zbog tipa podataka. Kod oba dendograma tri različite grupe su dobijene kod većine genotipova i smeštene su u prvom klasteru. Grupisanja su pokazala da nema asocijacije između geografskog porekla i divergentnosti. Od 17 prajmera koji su proizveli 108 polimorfnih traka 12 je pokazalo kompletan polimorfizam. Utvrđene su maksimalne (0.98) i minimalne (0.42) genetičke sličnosti. Rezultati pokazuju da se ove tehnike mogu koristiti kao ekonomske i brze u determinaciji diverziteta između genotipova šafrana.
Autor za kontakt: F. Izadpanah, Odelenje za hortikulturu, Poljoprivredni fakultet, Univerzitet u Teheranu, Karaj 31587, Iran, Tel.: +98 263 2248 721; fax: +98 263 2248 721, E-mail addresses: izadapanah@ut.ac.ir, izadpanah_f@yahoo.com
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 723-731
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
RUKOST I FENOTIPSKE KARAKTERISTIKE GLAVE I LICA
Milena CVETKOVIĆ 1, i Perica VASILJEVIĆ 2
1 OŠ ‘’Sreten Mladenović Mika’’ Niš, Srbija
2Prirodno-matematički fakultet, Univerzitet u Nišu, Srbija
Izvod
Kraniofacijalne karakteristike se koriste da bi se utvrdile sličnosti i razlike između humanih populacija ili unutar jedne populacije ljudi. Cilj ovog rada je dobijanje podataka o razlikama/sličnostima između dve grupe dece, levorukih i desnorukih dečaka i devojčica, na osnovu parametara koji određuju fenotipske karakteristike glave i lica: dimenzije glave, dimenzije lica, boje kose, boje očiju i oblika ušnog režnja. 1354 učenika regularnih škola jugoistočne Srbije uzrasta 7-15 godina je učestvovalo u ovom istraživanju. Kao instrumenti upotrebljeni su Edinburg upitnik za određivanje rukosti, kefalometar i anketni list. Levorukost se javlja kod 135 učenika (9,97%), a razlike u posmatranim parametrima su zabeležene između levorukih i desnorukih devojčica u odnosu na cefalični indeks, nazalni indeks, širinu glave, širinu lica i boju očiju.
Autor za kontakt: Cvetković Milena, OŠ ‘’Sreten Mladenović Mika’’ Šabačka 20, Niš, Srbija; phone: +381184232869, fax +381184535300 e-mail: tasan@mts.rs
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 733-739
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
MUTANT GENA XRCC3 241Met KOJI KONTROLIŠE POPRAVKU DNK I OSETLJIVOST KANCERA DOJKE KOD AZERI POPULACIJE U IRANU
Sahar GOHARI-LASAKI1, Jalal GHARESOURAN1,Morteza GHOJAZADEH2,Vahid MONTAZERI3, Hakimeh SAADATIAN1,Seyyed MOJTABA MOHADDES ARDEBILI1,3*
1 Odelenje medicinske genetike, medicinski fakultet, Tabriz Univerzitet medicinskih nauka, Tabriz, Iran
2 Odelenje RDCC, medicinski fakultet, Tabriz Univerzitet Medicinskih nauka, Tabriz, Iran
3 Odelenje opšte hirurgije, medicinska škola, Tabriz Univerzitet medicinskih nauka, Tabriz, Iran
3 Istraživački centar za hematologiju i onkologiju, Tabriz Univerzitet medicinskih nauka, Tabriz, Iran
Izvod
DNK – reper sistemi su ključni za popravku oštećenja kada dolazi do rekombinacije homologih hromozoma. Gen XRCC3 (X-ray cross complementing group 3) kodira jednog člana RecA/Rad51 - zavisne porodice protein koji učestvuje u homologim rekombinacijama u cilju održanja stabilnosti hromozoma i popravku oštećenja. Thr241Met (XRCC3-18067C>T, rs861539), substitucije odnosno tranzicija C u T u kodonu 241 u egzonu 7 koja ima kritičnu ulogu u razvoju kancera. Cilj ovih ispitivanja je bila asocijacija između XRCC3 Thr241Met polimorfizma i rizik sporadičnog kancera dojke u Azari populaciji. Vršena su ispitivanja polimorfizma XRCC3 Thr241Met u uzorcima DNK 100 sporadičnih pacijenata i 100 zdravih žena, metodom PCR-RFLP. Naši rezultati ukazuju da kod žena u fazi pre menopauze rizik pojave kancera dojke nije značajno povezan sa rs861539 u Azari populaciji
Autor za kontakt: Seyyed Mojtaba Mohaddes Ardebili, Istraživački centar za hematologiju i onkologiju, Tabriz Univerzitet medicinskih nauka, Tabriz, Iran,Email:Mohaddesmo@yahoo.com, Cell phone: +989141170345
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 741-750
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
ALELNI STATUS MIKROSATELITSKOG MARKERA Xgwm261 GENA Rht8 KOD GENOTIPOVA EGIPATSKE HLEBNE PŠENICE (Triticum aestivum L.) PRIZNATIH
UPERIODU 1947 - 2014
Khaled F M Salem
Odelenje za biljnu biotehnologiju, Institut za genetičko inžejerstvo i istraživanja u biotehnologiji (GEBRI) Univerzitet Sadat City, Egipat
Izvod
Rht8 se koristi u klimatskim uslovima Mediterana u kom povećava adaptibilnost biljaka. Microsatelit, Xgwm261 locus kod pšenice, čiji je alel veličine 192-bp allele blisko ukopčan sa genom Rht8, na hromozomu 2D unutar 0,6cM i kontroliše smanjenje visine biljke, je upotrebljen za skrining 30 genotipova egipatske hlebe pšenice. Clj je bio procena variranja tog lokusa. Utvrđeno je da u kolekciji pšenice postoje tri najfrekventnija alela: Xgwm261-165 (65.52%) Xgwm261-174 ( 24,14%) i Xgwm261-192.(10,34%). Genetičko nasleđivanje egipatskih genotipova u lokusu mikrosatelita Xgwm261 je posledica nove roditeljske komponente koja nosi osobinu niske biljke i ranostasnost i daje potomstvo sa ovim osobinama, korisnim za programe oplemenjivanja.
Autor za kontakt: K.Salem, Odelenje za biljnu biotehnologiju, Institut za genetičko inžejerstvo i istraživanja u biotehnologiji (GEBRI) Univerzitet Sadat City, , P. O. Box, 79, Egipat,E-mail: salemcairo@yahoo.com
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 751-763
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575.633
Originani naučni rad
AKUMULACIJA I REMOBILIZACIJA SUVE MATERIJE KOD OZIMOG JEČMA
U ZAVISNOSTI OD GENOTIPA I ROKA SETVE
Milan MIROSAVLJEVIĆ1*, Novo PRŽULJ2, Vojislava MOMČILOVIĆ1, Nikola HRISTOV1, Ivana MAKSIMOVIĆ3
1Institut za ratarstvo i povrtarstvo, Novi Sad, Srbija,
2Poljoprivredni fakultet, Unuverzitet u Banjoj Luci, Banja Luka, Bosna i Hercegovina
3Poljoprivredni fakultet, Univerzitet u Novom Sadu, Novi Sad, Srbija
Izvod
Poznavanje uticaja genotipa i roka setve na produkciju suve materije kod ozimog ječma značajno je za pravilnu primenu agrotehničkih mera. U ovom radu prikazana je akumulacija, remobilizacija i raspodela suve materije kod šest genotipova ječma različitog porekla i ranostasnosti (rani, srednje rani i kasni), sejanih u četiri roka setve. Generalno, prinos zrna i sadržaj suve materije smanjio se kod kasnijih rokova setve posle polovine oktobra. U odnosu na optimalan rok setve početkom oktobra, usled setve krajem oktobra prosečan prinos smanjio se za 14,2%, a setvom u novembru za 16,9%. Kod ispitivanih genotipova, kasne i srednje rane sorte su u proseku ostvarile viši prinos zrna u odnosu na rane. Kasna setva smanjila je akumulaciju suve materije do cvetanja, što je dovelo i do smanjenja remobilizacije organske materije akumulirane do cvetanja i njenog doprinosa u formiranje prinosa zrna. Na osnovu datih podataka može se zaključiti da u godinama sa povećanim prolećnim padavinama setva srednje ranih i kasnih sorti ozimog ječma omogućava bolju akumulaciju suve materije, i ostvarivanje viših prinosa zrna.
Autor za kontakt: Milan Mirosavljević, Institut za ratarstvo i povrtarstvo, Maksima Gorkog 30, 21000 Novi Sad, SrbiJa; Phone: 381214898220; Fax: 381214898227 E-mail: milan.mirosavljevic@nsseme.com
Štampano u „GENETIKA“ Vol. 47, broj 2 (2015), str: 765-776
© 2015 Društvo genetičara
Srbije
S. Bajića 1, 11185 Beograd – Zemun
Srbija
UDC 575
Originani naučni rad
ANTROPOGENETIČKA VARIJABILNOST U GRUPAMA HOMO-
I HETROSEKSUALNO OPREDELJENIH POJEDINACA
Suzana CVJETIĆANIN
Institut za humanu genetiku,Medicinski fakultet Univerziteta u Beogradu
Izvod
Koristeći test za utvrđivanje homozigotno recesivnih osobina kod ljudi (HRO-test) u ovoj populaciono-genetičkoj studiji upoređivana je morfofiziološka i genetička varijabilnosti u grupi homoseksualno opredeljenih pojedinaca iz Srbije (N=96) sa kontrolnom grupom heteroseksualaca (N=96). Rezultati naše studije pokazuju prisustvo zanačajnih razlika kako u prosečnim vrednostima genetičke homozigotnosti (kontrola 5.0+0.2 ; homoseksualci 3.4 +0.1 HRO, od 20 testiranih karakteristika), tako i u distribuciji i varijabilnosti u prisustvu specifičnih kombinacija testiranih osobina. Ovi rezultati upućuju na kompleksnu poligensku razliku među testiranim grupama ispitanika. Razlike u stepenu genetičke homozigotnosti među polovima, u okviru pojedinačnih grupa nisu utvrđene. Međutim, homoseksualno orijentisane osobe oba pola pokazuju značajno smanjenu genetičku homozigotnost i uvećanu varijabilnost u poređenju sa heteroseksualno opredeljenim ženama i muškarcima.
Autor za kontakt: Suzana Cvjeticanin, Institute of Human Genetics, School of Medicine, University of Belgrade,Visegradska 26, 11000 Belgrade, Serbia,Tel/Fax. +381 11 3607040,Tel +381 60 3534821,E-mail: cujasimsi@gmail.com